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羊肚菌是珍稀名貴的食用和藥用真菌，在國內(nèi)外市場備受青睞，干品價格高達2000元/kg。由于該屬物種形態(tài)特征高度可塑，僅靠傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)特征基本無法辨別物種。過去我國報道的新分類單元僅5個，且種間區(qū)別不易界定。該屬個別種有望實現(xiàn)商業(yè)化栽培，但尚無可靠的物種識別標準或物種DNA條形碼，也無準確的科學(xué)名稱，這既不利于知識產(chǎn)權(quán)申請，也不利于今后的良種選育。開展羊肚菌物種多樣性、系統(tǒng)發(fā)育與起源演化研究，可為羊肚菌人工栽培、物種資源利用與保護提供科學(xué)依據(jù)。

中國科學(xué)院昆明植物研究所楊祝良研究組，在2003–2011年間對我國21省市羊肚菌資源進行了廣泛野外調(diào)查和采集，積累標本900余份，在形態(tài)學(xué)研究基礎(chǔ)上，對其中的361份進行了ITS測序，據(jù)此篩選出可能為不同物種的代表標本70份，利用另外4個分子標記對它們進行了測序，結(jié)合業(yè)已發(fā)表的有關(guān)序列，與美國農(nóng)業(yè)部O’Donnell實驗室合作，采用新近流行的分析方法，對羊肚菌屬的物種多樣性、起源時間、分布格局、擴散路線和演化歷史進行了研究。部分研究成果已在真菌學(xué)主流期刊Fungal Genetics and Biology在線發(fā)表（http://dx.doi.org/10.1016/j.fgb.2012.03.006）。

該文的主要新意在于：發(fā)現(xiàn)中國共有30個物種，其中20種迄今僅見于中國，11種為新物種，中國的物種比整個歐洲的或北美的都多，提出東亞或中國是羊肚菌屬的現(xiàn)代物種多樣性中心；羊肚菌屬可能在晚侏羅紀至早白堊紀時起源于北美西部，多數(shù)物種可能通過白令陸橋傳播至亞洲，并且歐亞物種之間進行過交流和擴散；晚中新世時，干旱和氣候的變化導(dǎo)致了北美和歐洲兩地區(qū)部分物種滅絕，生境的片斷化引起部分異域物種形成；青藏高原隆升與物種分化有密切聯(lián)系，東亞約90%的物種是自中中新世至今分化出來的（見附圖）。

該研究得到NSFC-云南聯(lián)合基金重點項目（U0836604）、國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃（2009CB522300）等資助。