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中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所
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科研進(jìn)展

iFlora系列進(jìn)展之一:基于DNA條形碼的“國(guó)家重點(diǎn)保護(hù)野生植物鑒定信息平臺(tái)”建設(shè)基本完成

文章來(lái)源:  |  發(fā)布時(shí)間:2013-12-23  |  作者:種質(zhì)資源庫(kù)、生地室、信息中心  |  瀏覽次數(shù):  |  【打印】 【關(guān)閉

 

  新一代智能植物志iFlora計(jì)劃的階段性目標(biāo)之一是構(gòu)建中國(guó)維管植物和重要大型真菌的開(kāi)放、共享的數(shù)據(jù)平臺(tái)。結(jié)合中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所“一三五”任務(wù)的實(shí)施,在國(guó)家科技部科技基礎(chǔ)性工作專(zhuān)項(xiàng)項(xiàng)目和國(guó)家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目的支持下,項(xiàng)目組依托中國(guó)西南野生生物種質(zhì)資源庫(kù)、中國(guó)科學(xué)院生物多樣性和生物地理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(標(biāo)本館)和科技信息中心,構(gòu)建了iFlora的一個(gè)重要共享平臺(tái)— “國(guó)家重點(diǎn)保護(hù)野生植物鑒定信息平臺(tái)”(相關(guān)鏈接見(jiàn)http://www.iflora.cn/)。

  《國(guó)家重點(diǎn)保護(hù)野生植物名錄》是我國(guó)政府正式發(fā)布的一個(gè)保護(hù)植物名錄,所列物種分為I、II兩個(gè)保護(hù)級(jí)別。第一批名錄于1999年8月4日經(jīng)國(guó)務(wù)院批準(zhǔn),在1999年9月9日由國(guó)家林業(yè)局和農(nóng)業(yè)部聯(lián)合正式頒布施行,包括了92科194屬254個(gè)類(lèi)群(I級(jí)51個(gè),II級(jí)203個(gè))。由于植物分類(lèi)學(xué)者在某些分類(lèi)處理上存在不同看法,因此,在實(shí)際應(yīng)用時(shí),對(duì)第一批名錄的物種數(shù)統(tǒng)計(jì)并不完全一致。例如,中國(guó)數(shù)字標(biāo)本館(CVH)接受的物種數(shù)為285種(含亞種和變種,下同);基于Flora of China統(tǒng)計(jì)的物種數(shù)則為305種。

  該平臺(tái)是依據(jù)《國(guó)家重點(diǎn)保護(hù)野生植物名錄》(第一批)進(jìn)行構(gòu)建的,為了盡可能全面地覆蓋該名錄所列類(lèi)群,項(xiàng)目組組織專(zhuān)家進(jìn)行了為期兩年的材料整理和采集,完成了名錄所列90%類(lèi)群的樣品收集(其余10%的類(lèi)群主要是因?yàn)闃O度瀕危,甚至在野外無(wú)法采到),并采集了對(duì)應(yīng)的標(biāo)本和照片。依托種質(zhì)資源庫(kù)的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)平臺(tái),分別獲取了采集樣品的4個(gè)DNA條形碼片段(ITS、matK、rbcL、trnH-psbA),約計(jì)3000個(gè)DNA條形碼。利用相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)和計(jì)算機(jī)技術(shù),通過(guò)構(gòu)建“國(guó)家重點(diǎn)保護(hù)野生植物DNA條形碼參考型數(shù)據(jù)庫(kù)”,初步建設(shè)了“國(guó)家重點(diǎn)保護(hù)野生植物鑒定信息平臺(tái)”。

  該平臺(tái)以保護(hù)目標(biāo)植物(真菌)類(lèi)群DNA條形碼數(shù)據(jù)的獲取為基礎(chǔ),并整合了部分近緣類(lèi)群的DNA條形碼數(shù)據(jù),以及相關(guān)的物種信息、種質(zhì)資源信息、實(shí)物照片信息和地理信息等,提供了快速搜索、圖片識(shí)別、DNA條形碼、名錄索引、分等級(jí)檢索和高級(jí)搜索等6個(gè)認(rèn)知植物的功能和入口,讓用戶(hù)不僅能夠快速找到和識(shí)別自己的搜索目標(biāo),而且在搜索過(guò)程中能夠快速認(rèn)知和準(zhǔn)確鑒定國(guó)家重點(diǎn)保護(hù)野生植物。

  該平臺(tái)的建成將為我國(guó)生物多樣性研究、保護(hù)和可持續(xù)利用提供重要的技術(shù)支撐,同時(shí)對(duì)宣傳和普及植物科學(xué)知識(shí)、提高公眾對(duì)生物多樣性的認(rèn)知等方面將發(fā)揮重要作用。有利于國(guó)家相關(guān)行業(yè),特別是林業(yè)、農(nóng)業(yè)和海關(guān)等相關(guān)部門(mén)對(duì)國(guó)家重點(diǎn)保護(hù)野生植物的保護(hù)和監(jiān)管,為我國(guó)生物多樣性保護(hù)與可持續(xù)發(fā)展和生態(tài)文明建設(shè)做出貢獻(xiàn)。


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