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iFlora系列進(jìn)展之一:基于DNA條形碼的“國家重點保護(hù)野生植物鑒定信息平臺”建設(shè)基本完成

文章來源:  |  發(fā)布時間:2013-12-23  |  作者:種質(zhì)資源庫、生地室、信息中心  |  瀏覽次數(shù):  |  【打印】 【關(guān)閉

 

  新一代智能植物志iFlora計劃的階段性目標(biāo)之一是構(gòu)建中國維管植物和重要大型真菌的開放、共享的數(shù)據(jù)平臺。結(jié)合中國科學(xué)院昆明植物研究所“一三五”任務(wù)的實施,在國家科技部科技基礎(chǔ)性工作專項項目和國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃項目的支持下,項目組依托中國西南野生生物種質(zhì)資源庫、中國科學(xué)院生物多樣性和生物地理學(xué)重點實驗室(標(biāo)本館)和科技信息中心,構(gòu)建了iFlora的一個重要共享平臺— “國家重點保護(hù)野生植物鑒定信息平臺”(相關(guān)鏈接見http://www.iflora.cn/)。

  《國家重點保護(hù)野生植物名錄》是我國政府正式發(fā)布的一個保護(hù)植物名錄,所列物種分為I、II兩個保護(hù)級別。第一批名錄于1999年8月4日經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn),在1999年9月9日由國家林業(yè)局和農(nóng)業(yè)部聯(lián)合正式頒布施行,包括了92科194屬254個類群(I級51個,II級203個)。由于植物分類學(xué)者在某些分類處理上存在不同看法,因此,在實際應(yīng)用時,對第一批名錄的物種數(shù)統(tǒng)計并不完全一致。例如,中國數(shù)字標(biāo)本館(CVH)接受的物種數(shù)為285種(含亞種和變種,下同);基于Flora of China統(tǒng)計的物種數(shù)則為305種。

  該平臺是依據(jù)《國家重點保護(hù)野生植物名錄》(第一批)進(jìn)行構(gòu)建的,為了盡可能全面地覆蓋該名錄所列類群,項目組組織專家進(jìn)行了為期兩年的材料整理和采集,完成了名錄所列90%類群的樣品收集(其余10%的類群主要是因為極度瀕危,甚至在野外無法采到),并采集了對應(yīng)的標(biāo)本和照片。依托種質(zhì)資源庫的分子生物學(xué)實驗平臺,分別獲取了采集樣品的4個DNA條形碼片段(ITS、matK、rbcL、trnH-psbA),約計3000個DNA條形碼。利用相關(guān)數(shù)據(jù)庫和計算機技術(shù),通過構(gòu)建“國家重點保護(hù)野生植物DNA條形碼參考型數(shù)據(jù)庫”,初步建設(shè)了“國家重點保護(hù)野生植物鑒定信息平臺”。

  該平臺以保護(hù)目標(biāo)植物(真菌)類群DNA條形碼數(shù)據(jù)的獲取為基礎(chǔ),并整合了部分近緣類群的DNA條形碼數(shù)據(jù),以及相關(guān)的物種信息、種質(zhì)資源信息、實物照片信息和地理信息等,提供了快速搜索、圖片識別、DNA條形碼、名錄索引、分等級檢索和高級搜索等6個認(rèn)知植物的功能和入口,讓用戶不僅能夠快速找到和識別自己的搜索目標(biāo),而且在搜索過程中能夠快速認(rèn)知和準(zhǔn)確鑒定國家重點保護(hù)野生植物。

  該平臺的建成將為我國生物多樣性研究、保護(hù)和可持續(xù)利用提供重要的技術(shù)支撐,同時對宣傳和普及植物科學(xué)知識、提高公眾對生物多樣性的認(rèn)知等方面將發(fā)揮重要作用。有利于國家相關(guān)行業(yè),特別是林業(yè)、農(nóng)業(yè)和海關(guān)等相關(guān)部門對國家重點保護(hù)野生植物的保護(hù)和監(jiān)管,為我國生物多樣性保護(hù)與可持續(xù)發(fā)展和生態(tài)文明建設(shè)做出貢獻(xiàn)。


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