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中國科學(xué)院昆明植物研究所
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昆明植物所報道蛋白質(zhì)琥珀酰化修飾參與植物響應(yīng)重金屬脅迫

文章來源:資源植物與生物技術(shù)重點實驗室  |  發(fā)布時間:2022-12-07  |  作者:李雄  |  瀏覽次數(shù):  |  【打印】 【關(guān)閉

 

  植物是環(huán)境中重金屬的主要接觸者和傳輸者,解析植物對重金屬的耐受和轉(zhuǎn)運機(jī)制對于通過分子育種應(yīng)對環(huán)境重金屬污染具有重要意義:一方面,可以培育重金屬低富集作物品種以保證食物安全;另一方面,可以培育重金屬超富集植物資源通過植物提取去除環(huán)境中的重金屬。轉(zhuǎn)錄組學(xué)、代謝組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)等技術(shù)是研究植物響應(yīng)重金屬脅迫機(jī)制的常用手段,但這些技術(shù)只能從基因、代謝物和蛋白質(zhì)的豐度變化上理解其對植物響應(yīng)重金屬的調(diào)控作用。蛋白質(zhì)翻譯后修飾(PTM)是一種有效調(diào)控蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、功能、定位、活性和互作的生物學(xué)機(jī)制。目前,已在生物體中發(fā)現(xiàn)超過200PTM類型,但許多PTM在植物體中的功能和作用機(jī)制都不清楚。 

  中國科學(xué)院昆明植物研究所的研究人員在通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析蔓菁對重金屬鎘(Cd)脅迫的響應(yīng)機(jī)制中發(fā)現(xiàn)乙?;D(zhuǎn)移酶/去乙?;?/span>酶的表達(dá)顯著受到Cd脅迫的影響(Li et al., 2021, Environmental Science and Pollution Research, https://doi.org/10.1007/s11356-020-11454-z),表明相關(guān)蛋白質(zhì)翻譯后修飾可能參與調(diào)控植物對Cd的響應(yīng)。由于發(fā)生在蛋白質(zhì)賴氨酸(K)上的酰基化修飾(如乙?;?、琥珀?;投辊;龋┩ǔ4嬖?/span>crosstalk(有共同的調(diào)控基因),研究人員通過Western blot檢測了蔓菁幼苗在Cd脅迫下的乙?;?、琥珀?;桶投辊;揎椝?,發(fā)現(xiàn)3種?;揎椂紝?/span>Cd脅迫有響應(yīng),其中琥珀?;揎棧?/span>在琥珀酰輔酶A的介導(dǎo)下將一個負(fù)電荷四碳琥珀酰基轉(zhuǎn)移到賴氨酸殘基的伯胺上的過程)水平變化更為明顯。為了探究琥珀?;揎椩诼柬憫?yīng)Cd脅迫中的功能,研究人員利用對照組和Cd處理組蔓菁材料進(jìn)行了定量琥珀?;揎椊M學(xué)分析。 

  研究結(jié)果總共鑒定到256個蔓菁蛋白質(zhì)上的547個琥珀?;揎椢稽c,這些琥珀酰化修飾的蛋白質(zhì)定位在不同細(xì)胞組分并參與植物的各種生物學(xué)過程。在Cd20 μM)處理8小時后,檢測到8個蛋白質(zhì)上的9個琥珀?;稽c的修飾強(qiáng)度發(fā)生顯著變化(P < 0.05),這些差異的琥珀?;揎椢稽c在十字花科植物中十分保守并且絕大多數(shù)位點都處在蛋白質(zhì)的核心結(jié)構(gòu)域上(圖1),暗示這些琥珀酰化修飾位點對蛋白質(zhì)的功能可能具有重要影響。 

  研究還發(fā)現(xiàn)3個差異琥珀?;揎椢稽c發(fā)生在調(diào)控過氧化氫(H2O2)代謝和谷胱甘肽(GSH)代謝(植物對重金屬解毒的2個重要過程)的3個關(guān)鍵酶上(圖2):乙醇酸氧化酶(glycolate oxidaseK150位點下調(diào))和過氧化氫酶(catalase 3K396位點上調(diào))分別調(diào)控H2O2的生成和降解,谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶(glutathione S-transferaseK197位點下調(diào))催化GSHCd離子結(jié)合。由于3種酶的活性在Cd脅迫下也發(fā)生顯著變化(圖2),推測3個差異琥珀?;揎椢稽c可能通過調(diào)控相應(yīng)蛋白質(zhì)的活性增強(qiáng)蔓菁對Cd脅迫的耐受性。 

  該研究首次報道蛋白質(zhì)琥珀?;揎梾⑴c植物響應(yīng)重金屬脅迫,為解析植物耐受和轉(zhuǎn)運重金屬的機(jī)制提供了新的視角和參考,研究結(jié)果以Quantitative Succinyl-Proteome Profiling of Turnip (Brassica rapa var. rapa) in Response to Cadmium Stress為題發(fā)表在MDPI旗下SCI期刊Cells上。李雄博士為論文的第一作者,楊永平研究員和許建初研究員為論文的共同通訊作者,研究得到了中國科學(xué)院青年創(chuàng)新促進(jìn)會(2020387)和國家自然科學(xué)基金(31800226)的支持。 

  文章鏈接

 

1 差異琥珀?;揎椢稽c在十字花科植物中的保守性和在蛋白質(zhì)序列上的位置信息。 

 

2 差異琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)參與的生化反應(yīng)過程和H2O2GSH代謝中的關(guān)鍵酶活性或產(chǎn)物含量。 

(責(zé)任編輯:李雪)

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