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　　開花轉型時間決定了植物適合度并受一個復雜基因調控網絡調控，該網絡整合了內在遺傳和外在環(huán)境因素的響應，如AGL16等MADS-box轉錄因子在開花時間調控過程中起到了重要作用（Hu et al. 2014）；但AGL16在基因組水平上如何影響下游基因及其表達仍未知。

　　最近，中國科學院昆明植物研究所胡金勇團隊與郭振華團隊合作，基于染色質免疫共沉淀聯(lián)合高通量測序和一系列遺傳學和生化與分子實驗，對AGL16下游基因譜進行了系統(tǒng)識別。研究發(fā)現(xiàn)，AGL16能廣泛結合到超過2000多個基因的潛在啟動子區(qū)域的CArG-box上；在已知約400個開花基因清單中，AGL16能結合到近70個在不同開花路徑中起調控作用的基因上，意味著AGL16調控開花時間的遺傳結果可能為不同路徑的凈效應。進一步分析表明AGL16可結合到關鍵開花促進基因SOC1啟動子的多個區(qū)域，并抑制其表達；同時，AGL16與SOC1形成異源蛋白復合物并分享一系列共同靶標基因，二者部分相互依賴負調控了基因組水平的基因表達；遺傳學分析表明，AGL16功能缺失在SOC1功能突變背景下使擬南芥開花更加提前。研究不僅揭示了AGL16-SOC1復合體的復雜互作和調控模式，也為進一步解析開花時間調控網絡的復雜機制奠定了基礎。 

　　近日，研究以AGL16 regulates genome-wide expression and flowering time with partial dependency on SOC1 in Arabidopsis為題，在線發(fā)表于Plant Physiology上。中國科學院昆明植物研究所董雪博士開展了全部生物信息學分析和部分遺傳學實驗，為文章第一作者。張利平博士開展了大部分染色質免疫共沉淀實驗和部分生化實驗，湯銀華和于冬梅博士開展了部分蛋白互作實驗，其他作者參與了樣品收集和部分數(shù)據分析等工作。胡金勇和郭振華研究員為共同通訊作者。研究得到了國家自然科學基金（31570311、31501034、31700275、31800261）和中國科學院先導B（XDB31000000）等支持，還部分得到了中國西南野生生物種質資源庫和中國科學院東亞植物多樣性與生物地理學重點實驗室植物多維成像及多樣性分析等平臺的幫助。 

　　文章鏈接

圖1. AGL16可結合到近70個開花基因的啟動子區(qū)間 

圖2. AGL16與SOC1形成異源蛋白復合體 

　　圖3. AGL16-SOC1共享靶標基因